pubmed 由下往上搜尋hexosaminidase A

這次作業是要由下往上(由蛋白質找序列、基因，並找到疾病相關資料)
相關方法如下

1.由NCBI Entrez進入，選nucleotide database，key words: hexosaminidase A，就會出現相關RNA的資料。關於人類(homo sapeins)還會特別標紅字。

2.點選Homo sapiens hexosaminidase A (alpha polypeptide) (HEXA), RefSeqGene on chromosome 15，相關資訊於頁面所示，有他完整的reference sequence，簡單對此gene功能的介紹。

頁面中可見此gene缺陷時會造成的疾病。
右方有"all link from this record"，可進一步看gene的資訊，或選OMIM，查看對此gene更詳細的解說。

3. 從gene這個連結進入，可看到gene部分的資料。

4.從OMIM進入，可看到對此gene相關文獻資料。

文獻資料很豐富，還有附完整的參考文獻。

pubmet搜尋

這次作業是用特別的分類符號搜尋基因資料
先從最簡單的開始

進入pubmed，資料類別選gene，關鍵字 vitamin D

前去此網頁

再來要使用title和orgn
我打receptor[title]，物種選人homo sapiens[orgn]
結果共有8257筆資料，是代表人類這麼多receptor基因嗎?

 前去此網站

接著試試染色體[chr]和symbol[sym]

打5[chr] and "vitamin D"[sym]

結果沒有資料 = ="

前去此網站

接著找5[chr] and AST[sym]
有一堆名字有AST且在chormosome 5的基因

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene?term=5[chr] and AST*[sym]

接著是associated sequence accession number

不太確定要打什麼

在這篇資料有NC_00012.11，就給他打上去

結果還真的有資料 NC_000012.11[accn]

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene?term=NC_000012.11[accn]

再來是gene name[sym]
打VDR[sym]
果然找到跟vitamin D receptor 相關的基因

來到最後的作業
用的是PMID 文章的身分證號
打20512927[PMID]
結果如下

完成作業了
感覺這些詞性類別的標記還蠻好用的，
可以很快篩去一堆不重要的資料

Vitamin D 研究領域發表篇數分析

Vitamin D為最近熱門的研究題材，根據ISI資料，研究篇數與年代關係如下圖一。

其期刊主要發表作者如表一。

圖一、Vitamin D期刊篇數與年代關係 (資料來源: ISI)

 

表一、主要發表作者

何謂molecular biology?

我認為molecular biology是指從分子的角度來看整個生物學，探討生物體內肉眼無法看到的物質如何在其中扮演角色。舉例來說，基因、RNA、蛋白質如何調控整個生物體，並藉由何種相互作用來維持生命的運作，其即為molecular biology探討的東西。