MeV multiple expriment viewer

MeV multiple experiment viewer主要用來分析矩陣式的資料，舉凡microarray、96 well孔盤等。
可將每個資料點做相關性分群，看實驗組、對照組之間細部資料是否有差異性。

使用這套軟體第一步要先安裝Java
下載網址 http://www.java.com/zh_TW/
之後點TMEV.bat開始執行

 1. 打開後點file→Load data→就會出現下面視窗

2. 選擇要分析的資料類型

 

 3. 點選資料路徑

 

這邊是用Genepix 

4.下方會出現資料內容，在數字資料第一欄第一列的位置點選一下，告訴MeV這是第一筆資料

 5. 資料匯入後的結果
     點選set font type可調整呈現的字體大小

 6. 將資料Normalize (依total intensity)

 Normalize後的結果

 7. 儲存結果
     Save analysis: 存分析步驟、分析數值
     Save metrix: 存分析數值

 8. Hierarchial clustering，依gene和實驗組別相似性做2D cluster

 Cluster結果

 左方可見HCL tree，可修改其名稱

 9.另外可點tree的節點，挑出所要看的子cluster

 另外獨立分析

 獨立出來的session

 10. Visualization:可看各個基因之間的相關性

 點選各點，會顯示相關資料

 還可以點出胎的圖形

 11. 點選Clustering，做K-mean分析
       K-mean特點是自己設要分群的組數

 分群的結果

 可從左方列看圖形或表格結果

 12. 用CAST做分析
       CAST是依數據相關性自動分群

參數用預設的

 分析結果

 13. 做Normalize動作
       讓0.1和1的差異跟1和10的差異同樣凸顯出來

 Normalize的結果

 用線條來呈現